Markov Random Field Structure Estimator

Three algorithms for estimating a Markov random field structure.Two of them are an exact version and a simulated annealing version of a penalized maximum conditional likelihood method similar to the Bayesian Information Criterion. These algorithm are described in Frondana (2016) .The third one is a greedy algorithm, described in Bresler (2015)


Este pacote implementa algoritmos para a estimação de Campos Aleatórios de Markov a partir de uma amostra de variáveis aleatórias discretas. Desenvolvido como parte da dissertação do meu mestrado no IME-USP.

Escrito nas linguagens R e C++, utiliza o pacote Rcpp, que permite rodar código C++ a partir de uma chamada de uma função no R. Toda a interface do pacote para o usuário está em R. Está disponibilizado no reporsitório CRAN: https://cran.r-project.org/web/packages/mrfse/index.html Lá contém a documentação do pacote, incluindo a especificação das funções.

Versão atual: 0.4.1

Reference manual

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install.packages("mrfse")

0.4.2 by Rodrigo Carvalho, 2 years ago


Browse source code at https://github.com/cran/mrfse


Authors: Rodrigo Carvalho [aut, cre] , Florencia Leonardi [rev, ths]


Documentation:   PDF Manual  


GPL (>= 3) license


Imports Rcpp

Depends on gtools, Rfast

Linking to Rcpp


See at CRAN